Mikil óvissa ríkir um hvert endanlegt leiguverð Háskólans í Reykjavík verður til Reykjavíkurborgar fyrir afnot af bragganum umdeilda í Nauthólsvík. Leiguverðið átti að miðast við að endanlegur kostnaður yrði 158 milljónir króna en kostnaðurinn er nú þegar orðin um 415 milljónir króna þrátt fyrir að verkefninu sé ekki lokið. Menntastofnunin hefur þegar leigt hluta húsnæðisins út undir veitingastarfsemi og þiggur leigutekjur fyrir.
Samkvæmt leigusamningi sem HR og Reykjavíkurborg skrifuðu undir 16. júlí 2015, og var samþykktur af borgarráði, hljómaði leigusamningurinn upp á 450 þúsund krónur fyrir 446 fermetra eða um 1.009 krónur á fermetrann. Í samningnum er tekið fram að leiguverð sé tengt við vísitölu neysluverðs og ætti því leigan í dag að vera 482.083 krónur. Tekið er fram í leigusamningnum að fari kostnaður vegna framkvæmda yfir 158 milljónir mun leigan hækka í samræmi við þá kostnaðaraukningu og mun Reykjavíkurborg taka á sig um 67% af þeirri hækkun en HR 33%. Mun þetta því þýða einhverja hækkun á leigu fyrir HR.
Hversu mikil hækkunin verður er þó með öllu óljóst. Í samningum er sérákvæði þar sem fram kemur að séu framkvæmdirnar vegna minjaverndar taki Reykjavíkurborg allan kostnað vegna þess á sig. Ekki liggur fyrir hversu stór hluti kostnaðaraukningarinnar flokkast undir minjavernd og um það snýst deilan. Samkvæmt gögnum sem borgarráð og borgarstjórn Reykjavíkurborgar fékk á sínum tíma um verkefnið var framkvæmdin flokkuð sem minjavernd og getur það því flækt stöðuna fyrir Reykjavíkurborg krefjist þeir hækkunar á leigunni. Bjarni Brynjólfsson, upplýsingastjóri Reykjavíkurborgar, sagði í svari til DV að HR hafi ekki ennþá greitt neina leigu af húsnæðinu. Eins og komið hefur fram í fjölmiðlun hefur Háskólinn í Reykjavík þegar tekið hluta húsnæðisins í notkun, þó að afhendingin hafi ekki farið formlega fram.
Veitingahúsið Bragginn Bístró opnaði í miðjum júní síðastliðnum, en byrjað var að koma fyrir eldhústækjum í húsnæðinu í apríl. Í samtali við DV sagði Dalmar Ingi Daðason, veitingarstjóri á Bragganum, að hann vissi ekkert um leigusamning veitingastaðarins við HR og benti á föður sinn, Daða Júlíus Agnarsson. Þrátt fyrir ítrekaðar tilraunir náðist ekki í Daða við vinnslu fréttarinnar, svo ekki er vitað að svo stöddu hvort veitingastaðurinn sé byrjaður að borga leigu til HR eða ekki. Þegar blaðamaður DV mætti á svæðið ásamt ljósmyndara var einnig búið að koma fyrir sætum og sófum fyrir í húsinu þar sem frumkvöðlasetur HR á að vera. Sagði Dalmar að þau hefðu fengið það lánað hjá HR til að setja aukahúsgögn inn í fyrir geymslu en samkvæmt heimildum DV hafa verið haldin einkasamkvæmi í húsnæðinu sem áætlað var fyrir frumkvöðlasetur. Þar mátti sjá stór hljómflutningstæki merkt símafyrirtækinu Nova ásamt því að auglýsingar fyrir tilboð á áfengum drykkjum voru á borðunum.
DV ræddi við nokkra leigumiðlara sem sérhæfa sig í leigu á atvinnuhúsnæði og staðfestu þeir allir að leiguverðið í núverandi samningi væri afar lágt. Í samtali við DV sagði einn leigumiðlari: „Þúsund krónur á fermetra er algjörlega óþekkt þó það sé ekki vatns- eða vindhelt hús. Venjulega er verið að leigja svona húsnæði á 5 til 10 þúsund krónur á fermetrinn, annað er bara fráleitt. Þetta er ekki verð sem þekkist á markaðnum. þetta er bara eitthvað gæluverkefni, það er alveg augljóst.“ Samkvæmt leigumiðlurunum sem DV ræddi við eru fleiri verkefni á vegum borgarinnar þar sem í boði er leiguverð langt undir markaðsverði. Til dæmis Mathöllin á Hlemmi ásamt verkefni á Langholtsvegi þar sem verslunin Sunnutorg var, svo eitthvað sé nefnt.